姓名
Ioannis Michalopoulos

单位
雅典科学院生物医学研究基金会

头衔
博士

职位
员工研究科学家 – 副教授级别

研究兴趣和主要资助
研究兴趣：
- 基因组学
- de novo基因组组装
- 基因发现
- 基因组注释
- 系统基因组学
- 细胞遗传学
- 转录组学
- 基因差异表达
- 基因共表达
- 因果关系网络
- miRNA靶标发现
- 表观基因组学
- DNA甲基化差异
- 转录因子结合位点预测
- 蛋白质组学
- 药物基因组学
- 结构生物信息学
- 蛋白质结构拓扑
- 放射基因组学
- 与NASA和JAXA合作研究宇宙辐射和微重力的联合生物效应
- 机器学习
- COVID-19结果预测
- 网页开发
- 数据库设计

资助：
- Elixir-Greece Phase I: €33,500.00
- Elixir-Greece Phase II: €9,000.00
- miniNO (Horizon 2020): €25,000.00
- AWS (GRNET): €100,000.00

教育和职业经历简介
- 1993年 获得雅典大学生物学学士学位
- 2001年 获得圣安德鲁斯大学分子生物学博士学位
- 2001-2005年 在利兹大学生物化学和微生物学系担任生物信息学研究员
- 2006-2008年 在雅典科学院生物医学研究基金会基础研究中心II担任生物信息学研究员
- 2008年至今 在雅典科学院生物医学研究基金会系统生物学中心担任生物信息学研究科学家 – 副教授级别
- 2014年至今 在8个硕士课程中担任访问讲师
- 2022年至今 在雅典大学母婴健康与精准医学研究所担任生物信息学访问研究员 – C级

主要学术荣誉
- 2018年成为世界科学院准会员
- 1993年参与了威尔士大学生物科学学院的伊拉斯谟学生交换项目

代表性论文
- Zogopoulos V.L. 等（2023）。基于RNA-Seq的人类基因共表达分析网页工具HGCA2.0。《Cells》12：388。
- Zogopoulos V.L.、Malatras A. 和 Michalopoulos I.（2022a）。基于公共微阵列数据的拟南芥基因共表达分析。《STAR Protoc》3：101208。
- Zogopoulos V.L.、Saxami G.、Malatras A.、Papadopoulos K.、Tsotra I.、Iconomidou V.A. 和 Michalopoulos I.（2022b）。真核生物基因共表达分析方法。《Biology》11：1019。
- Zogopoulos V.L.、Saxami G.、Malatras A.、Angelopoulou A.、Jen C.H.、Duddy W.J.、Daras G.、Hatzopoulos P.、Westhead D.R. 和 Michalopoulos I.（2021）。拟南芥共表达工具：用于拟南芥基因共表达分析的工具。《iScience》24：102848。

其他学术成就
- 希腊计算生物学与生物信息学学会（HSCBB）创始成员（2006）
- HSCBB财务主管及国际计算生物学学会（ISCB）代表（2013-2017）
- 全球生物信息学学习、教育与培训组织（GOBLET）HSCBB代表（2013-2017）
- Elixir-GR生物信息学基础设施BRFAA代表（2012至今）
- Elixir-GR数据/工具平台副官员（2022至今）
- 世界科学院准会员（2018至今）
- 多次担任国内外会议的联合组织者
- 担任《核酸研究》、《生物信息学》、《口腔病理学与医学杂志》、《乳腺癌研究》、《PLoS One》、《BMC生物信息学》等期刊的审稿人
- 担任《Cells》、《Biology》、《BioTech》、《Genes》、《Metabolites》等期刊的专题/专题编辑